ECHA valdančioji taryba skiria apeliacinės komisijos narius pagal Europos Komisijos pasiūlytą kandidatų sąrašą.

Apeliacinės komisijos narių kvalifikacija yra apibrėžta Komisijos reglamente (EB) Nr. 1238/2007, nustatančiame Europos cheminių medžiagų agentūros apeliacinės komisijos narių kvalifikacijos taisykles.

Apeliacinę komisiją sudaro pirmininkas ir du kiti nariai. Apeliacinės komisijos nariai yra ECHA darbuotojai, tačiau jie turi būti nepriklausomi ir priimant sprendimus jų neturi saistyti jokie nurodymai. Jie Agentūroje negali eiti kitų pareigų. Narių kadencija – penkeri metai.

Be to, valdančioji taryba paskyrė pakaitinius ir papildomus narius. Jie nėra Agentūros darbuotojai, tačiau apeliacinė komisija juos kviečia spręsti bylų nesant narių arba, jei reikia, siekiant užtikrinti pakankamą apeliacinių skundų nagrinėjimo spartą.

Apeliacinei komisijai pareigas vykdyti padeda kanceliarija.